El IEFP está dotado de autonomía administrativa, financiera y patrimonio propio, bajo supervisión del Ministerio de Trabajo, Solidaridad y Seguridad Social. Por Ley, es el servioio público de empleo nacional. 

El Decreto-Ley Nº 13/2015 define los objetivos y principios de la política de empleo y regula la concepción, implementación, acompañamiento, evaluación y financiamiento de los programas y acciones puestas en marcha. En el artículo 5 plantea que es responsabilidad del IEFP la cooperación técnica en el campo del empleo y la formación, en el ámbito de las organizaciones internacionales y de los países extrangeros.

Tiene una estructura organizacional desconcentrada, flexible y de proximidad, que integra:

• Servicios Centrales 
• 5 Oficinas Regionales (Norte, Centro, Lisboa e Vale do Tejo, Alentejo y Algarve) 
• 30 Centros de Empleo y Formación Profesional 
• 23 Centros de Empleo 
• 1 Centro de Formación y Rehabilitación Profesional